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Dynamics
Ensemble:指定要在动力学模拟中使用的系综。 NVE-在固定体积和恒定能量下的动力学。 NVT-动态在固定的体积与恒温器,以保持恒定的温度。 NPH-在恒定焓下的动力学,用气压计保持恒定压力。 NPT-具有恒温器以保持恒定温度和气压计以保持恒定压力的动态特性。 Initial velocities:选择要用于动力学计算的速度初始化方法。可用选项包括: Random-将初始速度设置为随机值(默认值)。 Current-将初始速度设置为结构上当前定义的值。 Temperature:指定动力学模拟的温度。对于NVE系综,原子的初始随机速度被缩放到这个温度。 Pressure:指定NPH或NPT系综中动力学模拟的外部压力。对于Parrinello气压计,可以在“Stress”选项卡上指定全应力张量。 Time step:指定动力学模拟的时间步长。 Total simulation time:指定动力学模拟的总时间。当修改时,步骤数会针对当前时间步长进行适当调整。 Number of steps:指定动力学模拟的总步数。 Basis set for variable cell:指定晶胞格大小更改时基组的所需行为。 Fixed Basis Quality -平面波的数量变化以保持固定的截止能量 (需要在finite basis set correction处理基组校正)。 Fixed Basis Size-平面波的数量保持不变,因此有效截止能量会发生变化 (不需要在finite basis set correction处理基组校正)。 建议选择“Fixed Basis Quality ”。
Thermostat:指定用于NVT或NPT动力学的恒温器。可用选项包括: Langevin Nose NHL 只有在“Dynamics”选项卡上选择了NVT或NPT系综时,才会启用此选项。Nosé-Hooper Langevin(NHL)恒温器仅适用于NVT系综。 Barostat:指定用于NPH或NPT动力学的气压计。可用选项包括: Andersen-均匀缩放晶胞格 Parrinello-允许晶胞形状的变化 只有在“Dynamics”选项卡上选择了NPT或NPH系综时,才会启用此选项。 Langevin constant:指定Langevin NVT动力学过程中温度波动的阻尼时间。这个时间通常应该大于任何感兴趣的运动的时间尺度。 Nose Q ratio:为Nosé或NoséHoover Langevin NVT动力学的Nosé恒温器的虚拟精度Q指定比例因子。较大的Q比意味着增加了对温度波动的阻尼。 Cell time constant:指定特征晶胞时间,用于估计与气压计相关的精度。较大的值意味着压力波动的阻尼增加。
Wavefunction extrapolation scheme:指定在分子动力学步骤之间进行波函数外推的方法。当选择“使用扩展拉格朗日量(XL-BOMD)”时,此选择不可用。 None-不进行外推。 1st VV-具有可变系数的一阶外推。 2nd VV——可变系数的二阶外推。 2/1 VV——具有可变系数的二阶和一阶交替外推。 1st CC-常系数一阶外推。 2nd CC-常系数二阶外推。 2/1 CC-具有常数系数的交替二阶和一阶外推。 Use eXtended Lagrangian (XL-BOMD):当检查时,表明使用扩展拉格朗日分子动力学(Steneteg 2010,Niklasson 2011)代替波函数外推方案。扩展的拉格朗日公式允许使用明显更高的时间步长值,同时保持运动常数。此选项仅适用于固定晶胞(NVE和NVT)系综。默认值=选中。 Fix center of mass:选中时,表示质心将在动力学模拟过程中固定。默认设置为未选中。
此选项卡上的选项仅在请求晶胞优化时适用。 External stress:指定结构上外部应力张量的任何元素,单位为GPa。 Equivalent hydrostatic pressure:指定结构上的静水压力。 静水压力是应力张量迹的三分之一。当这里指定一个值时,应力张量的对角元素会被修改,从而使任何各向异性项保持不变。 外部应力和静水压力的正值表示结构受到压缩。 Reset external stress to zero:将应力张量的所有元素设置为零。 |



