详细内容

Process Builder

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Description:对生成的输入文档进行描述。

晶格Lattice

Type:指定进程的晶格类型。可用选项包括:

Oblique

Rectangular

Square

Hexagonal

Load from structure:根据激活的三维原子文档中的表面结构填充晶格类型、对称性、长度和Theta。

Theta:指定晶格单元的θ角度(以度为单位)。

Create:在过程查看器中打开新的过程文档。然后,您应该使用过程查看器的功能来添加Lattice Site和Species,并指定所需的过程。


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Symmetry:为过程选择表面的对称性。可用选项取决于指定的类型:

Oblique

p 1

p 2

Rectangular

p m

p 2 m m

Square

p 4

p 4 m m

Hexagonal

p 3

p 3 m 1

p 3 1 m

p 6

p 6 m m

u: 指定晶格单元长度u,单位为Å。

v: 指定晶格单元长度v,单位为Å。


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Description:对生成的输入文档进行描述。

Lattice:前面生成的输入晶胞参数

Sites:描述场景发生的事情

No:序号

Position:发生位点

Type:位点类型

Category:发生的事情


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Category:可以根据其功能进行分类

Adsorption site-可用于吸附物的位点

Substrate site-基质材料内的位点

Label-一个专家选项,可用于制定复杂的工作过程。它与单胞中的实际位点不对应。

Site type:指定吸附或底物位点位点的简化方法。

Top-基底原子顶部的位点,通常位于晶格的原点

Hollow-以紧密排列的方式位于空心顶部的位点

Bridge-晶格中相邻顶部位点之间的位点

Other-由单胞中的分数坐标指定的一般位点

X: 位点沿U方向的分数位点

Y: 位点沿V方向的分数位点

对于低对称性表面,没有很好地定义位点类型。在这种情况下,建议使用其他位点类型并指定所需位点的位点。

Add:根据指定的设置在当前过程文档的列表中创建一个新位点。


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创建反应物

Name:反应物名称

Category:发生的事情

Radius:半径

Charge:电荷

Color:显示的颜色


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查看结构


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与Site View联用,通过选择原子进行设置位点

Process index:过程的序号

Type:类型

Multiplicity:自旋度

对应类型的过程

是否使用其他的吸附

对应的位点+被吸附物质


Site environment位点的环境

Site位点

Nearest distance:最近距离

Enabling species:反应物质


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Use:是否使用

Index:序号

Identifier:名称定义

Type:发生事情

Spec:过程的类型


过程类型:

Adsorption:吸附

Desorption:解吸

Diffusion:扩散

Association:缔合

Dissociation:分解

Reaction:反应

General:包含全部


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与Processes相关联

Process index:Processes处的编号

Type:定义的类型

Identifier:名称定义

Description:对生成的输入文档进行描述

Charge transfer:电荷转移

Specfication type:规格类型


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Specfication type为Rates,速率

Rate coefficient:反应速率系数


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Specfication type为Immediate,目前的

priority:优先级


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Specfication type为Arrhenius,阿伦尼乌斯

Prefactor :指前因子v0

+P*:v1P

Activation energy:活化能E0

+Phi*:E1ɸ

Use interactions:使用相互作用

Bronsted-Polanyi factor:

Interaction cutoff:相互作用截断距离


image.png


image.png


Use:是否使用

Index:序号

Species1:物质1

Species2:物质2

Min.cutoff:最小截断距离

Max.cutoff:最大截断距离


Add用于添加物质1与物质2的相互作用

cutoff设置截断距离


image.png

前面设置的相关相互作用介绍


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