gen-vel
no: 不生成速度。当输入结构文件中没有速度时,速度设置为零,采样时不需要再输入,利用预平衡的速度进行输入。
yes: 根据温度 gen-temp 下的麦克斯韦分布,使用随机种子生成 gmx grompp 中的速度。这仅在 integrator=md 时才有意义。
gen-temp (300) [K]
Maxwell 分布所用温度。
gen-seed (-1) [integer]
用于初始化随机速度的随机生成器,当 gen-seed 设置为 -1 时,使用伪随机种子。