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2.3体积数据可视化

时间:2025-06-09     作者:邱新龙翻译【转载】   来自:VESTA官网   阅读

电子密度与核密度分布、波函数、静电势、帕特森函数等数据,可通过等值面、鸟瞰图和二维(2D)映射图实现可视化。多层级半透明等值面可与结构模型叠加显示。VESTA软件具备表面着色功能,可呈现等值面各点位其他物理量的分布特征——该功能经过全面重新设计后显著提升了成像质量。通过引入两个不透明度参数,VESTA在等值面轮廓与内部结构模型的可视化效果上取得突破性提升。此外,用户还可在三维图像中添加体数据的二维切片。即便在数据分辨率较低的情况下,VESTA渲染的等值面、边界截面与切片仍能保持极高精度。得益于采用全新算法,VESTA中等值面几何结构的计算效率获得显著提升。

VESTA具备根据结构参数和原子散射因子计算电子/核密度分布的功能,该功能对于比较最大熵法(MEM)与模型密度计算结果具有重要价值。

2.8展示了使用WIEN2k软件[41]计算得到的超导体MgB2[42]电子密度等值面。该图清晰呈现了z=1/2平面上高度共价性的B-B键网络,以及Mg2+离子(z=0)与B原子之间离子键的特性。图2.9则描绘了z=1/2高度处电子密度的(001)切面图。这类二维电子密度图在原子形成二维结构时尤为实用,例如高温超导氧化物中的CuO2导电层。

 

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2.8:MgB中的电子密度分布2。四个六边形单元胞的等面水平为0.11a−3(a0:玻尔半径)

 

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2.9:展示MgB₂中z=1/2平面上电子密度分布的(001)截面图。等高线绘制范围达0.5a0-3,间隔为0.05a0-3a0:玻尔半径)。

 

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2.10KH2PO4的准电相核密度分布。

 

2.10为基于mems的模式拟合[43]在室温下由KH2PO4(顺电相,空间群:42d)的中子粉末衍射数据确定的散射长度密度等值面。这样,两种不同的颜色被分配给正、负等值面。H原子的蓝色等值面(密度:−2.5fm/Å3)向O原子的黄色等值面(密度:2.5fm/Å3)延伸,这是因为H-H距离约为0.36Å的双最小电位。


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