12.1.5等值面

“Properties”对话框中的第五页是Isosurface（图12.8）。

材料

这与原子中的相同（见12.1.2）。

图12.8：属性对话框中的等值面页。

等值面

在等值面框的顶部，最小和最大数据值以原始数据的单位显示。电子和核密度、等面上的波函数等数据值等于{Isosurface level}，d(iso)。密度大于d(iso)的所有点位于等值面的内部，而密度小于d(iso)的点位于等值面的外部。

在框的下半部分，将显示等值面列表。要添加新的等值面，应单击New按钮，然后编辑等值面数值和颜色。要删除等值面，可在列表中选择一项，然后按下Delete按钮。按下Clear按钮将删除所有等值面。

多边形的渲染顺序 可以使用“Render from front to back从前到后渲染”选项，更改绘制多边形的顺序。默认情况下，多边形是从后面渲染的，因此最近邻表面后面的等值面通过半透明等值面可见。在某些情况下，对于复杂的等值面，可能很难理解等值面的形状，因为它们彼此严重重叠。选中Render from front to back选项时，仅渲染最近邻的表面。使用此选项有时可能会提高复杂等高线的可见性，因为既不绘制背面的表面，也不绘制内部表面。

图12.9显示了使用DVSCAT[58]的离散变分Xα方法对[Cd{S₄Mo₃(Hnta)₃}₂]⁴⁻离子(H3nta:硝基三乙酸（nitrilotriaceticacid）[79]的电子态计算结果进行三维可视化时两种呈现模式的差异。

图12.9：钼镉团簇{Cd[S4Mo3(Hnta)3]2}4-的两种绘制等值面的模式之间的比较：（A）Render from behind（默认）和（B）Render from front to back。根据静电势着色的电子密度等值面和球棍模型的合成图像，显示等值面级别为0.03a₀^-3，等值面上的静电势范围为-0.814 Ry（蓝色）至0.174 Ry（红色）。

等值面的种类

对于同时具有正值和负值的体积数据，您可以选择哪些面是可见的：

•正负值

•正值

•负值

图12.10举例说明了用DVSCAT计算的复离子波函数等值面，在等值面上叠加了球棒模型。黄色和蓝色表面分别显示正值和负值。等值面的不透明度通过两个参数{Opacity 1}(O1)和{Opacity 2}(O2)来指定，如图12.11所示。O1是平行于屏幕的多边形的不透明度，O2是垂直于屏幕的多边形的不透明度（图12.12）。法向量为（x,y,z）的多边形p的不透明度O(p)是用O1和O2:的线性组合来计算的

图12.10：{Cd[S4Mo3(Hnta)3]2}4-离子的64a1g轨道的球棍模型。波函数的等值面级别设置为0.01a₀^-3/2（黄色）和-0.01a₀^-3/2（蓝色），其中a0是玻尔半径。

图12.11：为C114H76的电子密度等值面和球棍模型的合成图像，具有两对不透明度参数：（A）O1=153，O2=255；（B）O1=26，O2=179。使用DVSCAT计算电子密度，并以0.01a₀^-3的等密度等级进行可视化。

表面着色

加载为表面着色的体数据后，可以根据这些数据对等值面进行着色。颜色的饱和度被指定为（a）在0和100之间归一化的值，以及（b）对应于原始数据的值。这基本上与晶格平面和等值面切面的颜色设置相同（见12.1.6节），但0和100的归一化值对应于当前等值面上的最小和最大数据值，而不是数据集本身。

图12.12：等值面方向与两个不透明度参数O1和O2之间关系的示意图。

确定值为d的数据点颜色的颜色指数T是从原始数据的单位计算的：在原始数据的单位中，最小饱和度水平Smin和最大饱和度水平Smax：

值大于Smax和小于Smin的数据点，分别被赋予与分配给Smin和Smax相同的颜色。