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2.3 ABACUS+DPGEN计算铍材料EOS、弹性模量，即通过性质计算验证计算方法的准确性2024.04.02ABACUS计算材料性质可参考陈默涵老师的中文教程，网址https://mcresearch.github.io/abacus-user-guide，以及Bohrium上的notebook《DFT（基于ABACUS）和基于MD（基于DeePMD-kit）的参考资料》目前我还没有完全练习，且教程在逐步完善中。 使用ABACUS做DFT计算，在做研究前需要确定所选的计算方法准确可行。验证方法是通过性质计算与其他实验或计算结果进行比较，本教程主要参考北京大学陈默涵老师的学生刘裕博士发表的论文（Copper-doped beryllium and beryllium oxide interface: A first-principles study）来做DFT正确性的前期验证。
关于DPGEN计算EOS的案例可参考刘建川的《ABACUS+DPGEN教程》的第四部分。 首先理解一下EOS计算的基本步骤，EOS是稳定结构附近体系能量随晶胞的变化情况。如果我们手头有个结构，这个结构不一定是最稳定的结构，因此第一步需要先对结构进行DFT优化，优化时需要优化晶胞。然后对晶胞进行一定比率的扩张或压缩，通过scf计算获取体系能量，进而画出体积和能量的关系图。 因此需要STRU文件、INPUT（晶胞优化）、INPUT（SCF计算）、势函数*.upf、或原子轨道基组lcao *.orb文件。DPGEN可调用ABACUS或DP势函数来计算材料的EOS。如果调用DPGEN做计算的话还需要DPGEN的输入文件relax.json,和porperty.json和DPGEN机器调用文件machine.json。 作者：朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com； 工作单位：石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院（AISI）访问学者2023.07-2024.09，访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech 截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解：铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址： https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新 注意：后续的更新，大部分会在Bohrium课程平台进行，请看教程入门的同学加入课程进行学习；且录制的视频课程会把一些个人观点给加入，从个人观点来看比文字教程的内容更多 写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备； ABACUS软件的QQ群：759914681，群内有专职开发人员，目前ABACUS提问问题以github的issue为主，群内可作为辅助提问。 欢迎大家推广本教程，让更多的dp入门学习者有个参考，目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师（我也报名了小马老师的一对一辅导）。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。 |