|
3.1.3 初始训练集相关讨论2024.04.03初始训练集的准备,可利用DPGEN的init功能准备,然后用DPGEN的run功能做训练集的完善(这也是本教程采用的主要方法)。也可以通过AIMD准备几个初始训练集,然后利用PDGEN的run功能准备数据集(入门培训课程《DeePMD:从入门到精通》建议),并做完善。两种方式通过后期的迭代,都能够训练出比较合理的函数,而我更倾向于用init功能创建相对来说比较丰富的数据集,自以为这样可以降低后期探索的时间。当然,如果做的研究涉及到过渡态、增强采样、化学反应等平衡结构不容易得到的构型。那么在准备初始训练集或后续迭代过程中,最好能够加入相应的构型数据。 本教程是我初次上手DPGEN的使用,学习半年后写的内容,以前我并不熟悉相关软件的使用,因此难免出现一些不成熟想法的地方。如果有不好的地方,大家可以在飞书文件中进行相关的评论)。该教程是我以新手的角度来学习DP势函数的拟合,且我以前没有VASP的使用经验,只是熟悉LAMMPS分子动力学模拟,因此欠缺经验在所难免。该教程针对的人群,主要是没有使用经验的初学者,后续会录制一个相关的视频来进行教学,而教学的主要人群会以我工作单位(石家庄学院)的本科生为例,通过学习,希望给们创造一个接触科研的平台和机会,并在后续的考研,升学中起到一定的作用。 作者:朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com; 工作单位:石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院(AISI)访问学者2023.07-2024.09,访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech 截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解:铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址: https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新 注意:后续的更新,大部分会在Bohrium课程平台进行,请看教程入门的同学加入课程进行学习;且录制的视频课程会把一些个人观点给加入,从个人观点来看比文字教程的内容更多 写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备; ABACUS软件的QQ群:759914681,群内有专职开发人员,目前ABACUS提问问题以github的issue为主,群内可作为辅助提问。 欢迎大家推广本教程,让更多的dp入门学习者有个参考,目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师(我也报名了小马老师的一对一辅导)。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。 |