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3.2.3 对所有初始可能构型进行init_bulk计算

对前期准备的一些典型构型进行计算，构型原子数、缩放系数、微扰个数，构型数量如下表。

在具体准备过程中，考虑的内容如下，首先模拟体系主要是hcp结构，因此和hcp结构相关的构型微扰和缩放设置比较多。（当然如果再考虑缺陷、间隙原子、表面等构型计算量会更大，目前先以掺杂温度影响扩散为目标进行前期的准备）

模拟构型

缩放系数

pert_numb

构型数量

Be16_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

6*7*11=462

Be54_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

462

Be128_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

1

154

Be32_fcc

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

462

Be108_fcc

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

1

154

Be15_Cu1_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

1

154

Be52_Cu2_hcp_sp_plane

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

462

Be53_Cu1_hcp_sa_plane

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

462

Be127_Cu1_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

1

154

Be31_Cu2_fcc

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

1

154

Be32_Cu1_fcc

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

1

154

Be46_Cu2_tetragonal

[0.95, 0.99, 1.00, 1.02]

1

88

Be47_Cu1_tetragonal

[0.96, 0.97, 1.00, 1.01]

1

88

Be53_Cu1_cubic

[0.94, 0.98, 1.00, 1.02]

1

88

Be52_Cu2_cubic

[0.95, 0.97, 1.00, 1.02]

1

88

Be53_Cu1_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

462

Be52_Cu2_hcp

[0.94, 0.96, 0.98, 1.00, 1.02, 1.04, 1.06]

5

462

准备初始训练集之后最好对所有的训练集的质量进行一下检测，以防某些体系力的分布出现较大的偏差，例如在我以前计算过程中就出现了Cu晶体受力在百量级其他训练集的力在五以内的情况，质量检测需要使用dpdata，暂时我还不算熟悉，等写完教程再学习。

准备完初始训练集之后就可以进行后续的势函数训练过程，在我做项目时就有写教程的准备，因此刚开始就用gitee仓库进行相关文件的准备和记录，在做完init_bulk之后，我将所有的生成的数据集按类别放到了同一个文件夹下，并上传到了gitee仓库，其他计算过程产生的文件并未上传。gitee仓库使用还有一个好处就是我再不同服务器进行计算时，只需要使用git pull命令就可以及时更新所有仓库的内容。gitee仓库的使用我会放到视频教程中进行演示，命令的学习可参考廖雪峰官网上的讲解。

  1. 用init_bulk计算init_surface

可能init_surface不支持ABACUS（支持VASP），因此可以用init_bulk来替代init_surf，需要模型中包含表面，优化时不优化晶胞等设置。

作者：朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com； 工作单位：石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院（AISI）访问学者2023.07-2024.09，访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech

截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解：铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址： https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新

注意：后续的更新，大部分会在Bohrium课程平台进行，请看教程入门的同学加入课程进行学习；且录制的视频课程会把一些个人观点给加入，从个人观点来看比文字教程的内容更多

写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备；

ABACUS软件的QQ群：759914681，群内有专职开发人员，目前ABACUS提问问题以github的issue为主，群内可作为辅助提问。

欢迎大家推广本教程，让更多的dp入门学习者有个参考，目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师（我也报名了小马老师的一对一辅导）。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。
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