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Dendrimer

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构造选项卡包含构造树枝状聚合物时最常用的选项。

使用的构造方法由您选择的Build选项控制:

Create a new dendrimer:选中时,表示将使用指定的选项创建新的树枝状聚合物。新聚合物将在新的3D原子文档中创建。

Add generations to constructed dendrimer:选择时,表示指定的构建块将被添加到现有树状结构上定义的连接点。

Seed structure:从提供的树枝状分子种子列表或屏幕上的结构中选择一个种子结构。树枝状分子种子是包含至少一个连接点的任何片段。

Repeat unit:从提供的重复单元列表或屏幕上的树枝状分子重复单元中选择要在树枝状分子构建中使用的重复单元。树枝状分子重复单元是具有头部原子(将附着在现有树枝状分子上)的任何片段。树枝状分子重复单元也可能包含一个或多个连接点。注意:提供的树枝状分子重复单元列表中以end_开头的条目没有连接点。由于这些结构终止了树枝状分子,因此您不能添加超过一代。

Number of generations:指定在构建过程中将向每个连接点添加多少世代。

Use simple names for constructed polymers:指示构建的树枝状聚合物是否应该有一个简单的默认名称,或者树枝状聚合物的名称应该基于重复单元的名称。默认=已检查。


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连接点选项卡包含允许您操作片段的机制,然后可以在树状分子构建过程中使用该片段,或者现有树状分子的连接点来影响下一代的生长。


Set:在连接点定义部分,将结构中当前选定的原子定义为连接点。如果原子已经定义为连接点,则将当前选定的原子添加到列表中。

Clear:从当前树状结构或种子中清除选定的连接点。


set:在头原子定义部分,将当前选定的原子定义为片段中的头原子。头原子是当片段与现有种子或树枝状聚合物结合时将在结合操作中被移除的原子。

虽然片段上允许任意数量的连接点,但只能定义一个头。(*这个头的定义主要要用下一代的处理)


由于目前的数据库较少,同时该模块无法进行自定义,只能采用自行添加完成数据库的生成

首先根据MS软件安装位置,进行搜索Dendrimer

找到下面的数据库文件


image.png


导出用Dendrimer定义好的结构,导出xsd,然后再存到对应文件夹

这个时候关机,不然MS可能一时读不出来

image.png]


开机后就可以画了

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