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非键作用势能表table-extension (1) [nm] 将非键合势能查找表扩展到最大截止距离之外。对于实际的非键相互作用,在截止点之外永远不会访问表。但是对于 1-4 相互作用,可能需要更长的表距,此表无论是否使用非键相互作用总会列出。 energygrp-table 当 user table 用于 静电 和/或 VdW 时,这里可以给出应使用单独用户表的成对能量组。 这两个能量组将按照它们在 energygrps 中的定义顺序附加到表文件名,并用下划线分隔。 例如,如果 energygrps = Na Cl Sol,energygrp-table = Na Na Na Cl, gmx mdrun 将读取table_Na_Na.xvg 和 table_Na_Cl.xvg 以及将用于所有其他能量组对的 table.xvg。 |