12.1.2原子

“Properties”对话框中的第二页是“Atoms”（图12.2）。

材料

•{Specular}是一种反射光的颜色，它以镜子的方式在特定方向上剧烈反射。高度镜面反射的光往往会在其照射的表面上产生亮点，这被称为镜面高光。

•{Shininess}是一个属性，它指定了镜面高光的大小和聚焦程度。值为0指定未聚焦的镜面高光。

分辨率

Stacks和Slices是所有原子共有的参数，可更改屏幕上显示的原子的分辨率（质量）。Stacks表示沿Z轴的划分数量（类似于纬度线），而Slices表示围绕Z轴的划分数量（类似经度线）。由于其中原子由完美球体表示，Stacks和Slices在球棍以及空间填充模型中应该彼此相等。通常，减少Stacks和Slices会加快图形区域中对象的渲染速度。

图12.2：属性对话框中的原子页面。

原子的样式

选择以下两个单选按钮中的任意一个，原子在图形区的显示方式为：(1)“Show as balls显示为球”或(2)“Show as displacement ellipsoids显示为位移椭球”。

•“显示为球”：原子呈现为球体。列表框{Radiitype}用于从以下三个选项中选择一种默认原子半径类型：

- Atomic原子半径：金属或共价半径，其值主要取自其他参考文献。

- Ionic离子半径：Shannon编制的代表性氧化态和配位数的有效离子半径。

- van der Waals：范德华半径。

用户可以通过编辑VESTA程序文件夹中的文本文件elements.ini来修改原子半径、离子半径和范德华耳斯半径的默认值。

•“Show as displacement ellipsoids显示为位移椭球”：原子被呈现为椭球来表示原子的各向异性位移，其形状由各向异性原子位移参数（βij或Uij）计算得出（参见6.3.5）。在{probability}文本框中输入原子核被包含在椭球中的概率（以百分比为单位）。绘制位移椭球时，对所有原子都是通用的。如果选中“显示主椭圆”选项，则在每个椭球表面绘制三个主平面对应的三个主椭圆（图12.3）。在文本框{linewidth}中输入主椭圆的线宽。

图12.3：原子的位移椭球（A）绘制主方向椭圆，（B）未绘制主方向椭圆。

图12.4：具有负均方位移的四原子结构的位移椭球模型。

如果一个或多个主轴具有负均方位移，则原子由长方体表示，从而可以容易地识别异常的原子位移参数（图12.4）。每个长方体根据主轴定向，长方体的尺寸根据均方位移的绝对值绘制。

•“Hide non-bonding atoms 隐藏非键原子”：此选项隐藏没有化学键连接的原子，但这些原子的晶体学位置具有大于0的配位数。换句话说，如果所有配位原子都位于绘制边界之外，原子就会变得不可见。

半径和颜色

从从Symbol列表框中选择元素的符号，然后指定其Radius。原子（元素）的颜色可以通过输入范围从0到255的R、G和B值，或者单击Select按钮后打开的颜色选择对话框中选取一种颜色进行设置。

图12.5：空间群Fd¯3m的常规位位图，(A)光禁用，(B)光启用。

标签

为原子标签选择以下两种类型之一：(1)“元素名称”或(2)“位点名称”。标签在原子附近显示，并沿z轴偏移，偏移量以Å单位指定。当选中“标记对构位点”选项时，由反转、旋转反转或镜像对称操作生成的原子将被标记为“，”符号。这些位置相对于未标记的位置是对映的。这个选项可以用来绘制类似于《国际晶体学表》（International Tables for Crystallography,Vol.A）中所示的常规位置图（图12.5）。当一个原子位置与一个对映对称元素重合时，原始位置和对映对称元素重合。这样的原子在原子的左半部分用“，”标记表示，中间用“|”隔开。