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Interface力场超小气体分子的参数(O2/H2/N2)

气体分子以及与液体和固体的界面在生物体、吸附、催化和环境中发挥着关键作用
但是早期力场参数在处理这些基本分子特性时误差非常大
Interface力场开发者Hendrik Heinz课题组开发了用于这些非常小分子的键伸缩谐振势和 Lennard-Jones 势(包含12-6 和 9-6)
(J. Chem. Theory Comput. 2021, 17, 5198)
优化参数时,键长拟合自转动光谱、键伸缩力常数拟合自拉曼峰频率、同时考拟合了液体密度(沸点以下)、汽化焓(沸点时到沸点以上)和水合自由能(298K/1atm)等



氢气有两套参数,原子类型H2为拟合蒸发焓及水合自由能的参数,原子类型H2a为拟合了蒸发焓及液相密度的参数
该力场参数仅包含水(推荐使用SPC)和3种气体分子
3种气体分子对应的pdb文件也同时提供

1:提供的Gromacs力场参数文件仅包含12-6形式(Gromacs程序不支持9-6形式),默认设置采用了LB混合规则,原文中提到几何平均的混合规则(规则3)对性质计算影响微乎其微,如与OPLS/GROMOS等力场合用则放心修改
2:此套参数适合于常温-低温度及常压的模拟状态,与Trappe_small力场的应用范围不同,并且有一定互补性(Trappe_small力场参数适用于高压/超临界状态的模拟)
3:此套参数中不涉及虚拟点及约束
4:应该使用1fs的步长及1.2A的vdW截断半径


IFF_samll_gas.ff.rar


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