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DeePMD应用案例讲解:铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示

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https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses


课程介绍:

本课程通过演示铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数DP拟合过程,引导新手学员快速上手,已达到降低DP势函数的入门门槛。

注意:由于讲师之一——朱雪刚,在2023年10月才开始接触机器学习势函数DP的拟合,因此相关课程内容和讲解可能不够准确,如果有误请在课程评论区进行反馈。根据反馈,后续课程会持续跟新,以达到培训新人DP入门的目标。 另外,截止到2024年7月,课程讲解主要以铍单晶DP势函数拟合演示为例,后续会根据相关内容,制作Bohrium平台Notebook,以便学习者上手练习。



课程目录

0. 研究前的准备(非必看)

0.1 学前提示-经验分享

0.2 研究背景,软件安装简介

0.3 git仓库管理附带软件安装和bash与python学习建议

1. DFT计算:ABACUS计算简介、收敛性测试等

1.1 启动abacus计算准备输入文件进行电子自洽迭代scf计算

1.2 ABACUS收敛性测试脚本编写和结果分析

1.3 DPGEN_ABACUS计算铍材料EOS和弹性模量

2. 准备初始训练集:DPGEN init_bulk使用

2.1 DPGEN_ABACUS准备初始训练集init_bulk功能讲解

3. DP势函数拟合迭代:DPGEN run使用

3.1 DPGEN_run启动势函数的迭代和第一次迭代

3.2 DPGEN势函数质量分析演示

3.3 DPGEN_autotest测试dp势函数质量_计算性质

3.4 DPGEN_model_dev中力的偏差最大和最小值确定讨论

4. DP势函数应用案例简介:薄膜生长模拟

4.1 DP势函数做MD计算简介,LAMMPS模拟扩散和薄膜生长

5 Bohrium Notebook 练习展示:课程后期更新修改,待补充(暂停更新2024.09.23)

5.1 DFT收敛性测试和性质计算

5.2 DPGEN init_bulk准备初始训练集

5.3 DPGEN RUN迭代DP势函数

5.4 DP势函数做MD模拟案例(扩散和薄膜生长)

6 NEP 和GPUMD的使用教程(待学习补充2024.09.23)

6.1 DP训练集转换到nep训练集中

6.2 NEP训练集的迭代(主动学习)

6.3 NEP势函数性质分析

6.4 NEP势函数的应用

7 NEP唐本瑞哔哩哔哩教程链接

NEP势函数的训练以及数据集的准备

NEP势函数主动学习的大致流程

如何构建数据集


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