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2.1 准备ABACUS计算文件 2024.02.22

ABACUS计算涉及到的文件包括:

1.STRU--结构文件;结构文件所包含的信息为:原子类型,所使用的势函数,晶格常数,晶胞信息,原子坐标和个数,是否固定原子,是否包含磁性等。具体STRU结构文件的信息建议参考官网,当然初学者可以先学习如何转换其他文件到STRU文件,等熟悉之后再去看ABACUS的官网文档

2.INPUT--计算过程控制文件:INPUT包含信息主要包括:计算方法(电子自洽迭代scf计算,动力学模拟md计算,等),截断能的选择, 最大scf迭代次数,势函数类型,对称性选择与否,K点设置,smearing展宽设置,是否输出受力和压力等内容。(INPUT的所有参数都有默认值,如果不设置相关参数则会使用默认值进行计算);

3. 原子间相互作用势函数文件*.upf,(如果想做快速计算的lcao计算,还需要使用轨道文件*.orb);

4.KPT文件(如果在INPUT中设置kspacing则无需该KPT文件,在准备DPGEN初始训练集时,由于包含不同大小晶胞的体系,因此使用kspacing更方便也更合理)。


作者:朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com; 工作单位:石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院(AISI)访问学者2023.07-2024.09,访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech

截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解:铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址: https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新

注意:后续的更新,大部分会在Bohrium课程平台进行,请看教程入门的同学加入课程进行学习;且录制的视频课程会把一些个人观点给加入,从个人观点来看比文字教程的内容更多

写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备;

ABACUS软件的QQ群:759914681,群内有专职开发人员,目前ABACUS提问问题以github的issue为主,群内可作为辅助提问。

欢迎大家推广本教程,让更多的dp入门学习者有个参考,目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师(我也报名了小马老师的一对一辅导)。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。


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