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2.2.1 ABACUS对pw 基组进行测试。2024.03.12

用bash做测试,需要先准备STRU文件、upf文件,然后用bash脚本生成INPUT文件和、KPT文件,并在INPUT文件中使用变量设置,通过控制变量进而达到自动计算任务的目标。同时为了作图方便,把python获取数据并作图也放在了bash脚本中。

此处之所以先试用pw进行测试,主要是因为pw的计算对于小体系来说基态能量可能更低,即更加准确。但是lcao原子轨道基组计算耗时更少。当然经过最终的测试,我们看出lcao基组计算结果和pw相差不大,误差在可接受范围,为了加快计算,最终我们会选择laco基组进行计算。

我第一次写脚本使用了两三周时间,此教程希望初学者在几天内完成想要的脚本,或者大家后续贡献更多的ABACUS的shell脚本或python脚本,降低新手入门时间。

另外,测试不同量的脚本基本类似,因此只详细介绍一个脚本,后续只给出参考脚本(不一定是最好的),和测试结果(ABACUS的3.4.0版本)的大概说明。


作者:朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com; 工作单位:石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院(AISI)访问学者2023.07-2024.09,访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech

截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解:铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址: https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新

注意:后续的更新,大部分会在Bohrium课程平台进行,请看教程入门的同学加入课程进行学习;且录制的视频课程会把一些个人观点给加入,从个人观点来看比文字教程的内容更多

写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备;

ABACUS软件的QQ群:759914681,群内有专职开发人员,目前ABACUS提问问题以github的issue为主,群内可作为辅助提问。

欢迎大家推广本教程,让更多的dp入门学习者有个参考,目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师(我也报名了小马老师的一对一辅导)。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。


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