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3.2 DPGEN init_bulk 准备初始训练集2024.04.04(缺少实操教学内容)DPGEN init_bulk的使用可以参考官方的DPGEN使用文档(英文),【DP-GEN教程】DP-GEN init 无痛上手指南。 准备初始训练集要尽可能的涉及到所研究的问题,针对铜掺杂铍多晶中的扩散研究,主要做铍单晶初始训练的准备、单个铜掺杂铍单晶初始训练集的准备、两个铜原子掺杂铍单晶初始训练集的准备。 如果为了模拟较高的温度,初始训练准备时尽可能考虑压缩和拉伸较大的情况。在分子动力学模拟中,势函数是非简谐形式的凹陷模型。原子在类似于凹陷的势井内进行震动,当温度足够高,原子的振动能或震动幅度足够大时,势能不能束缚住原子,原子会发生相对大的位移,进而材料就会展现出熔化现象。因此要模拟融化或相变在准备训练及时最好考虑拉伸和压缩幅度较大的初始训练集。(这是我对熔化的思考,但在我研究目的过程中并不涉及融化,因此没有考虑较大震动的幅度) 作者:朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com; 工作单位:石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院(AISI)访问学者2023.07-2024.09,访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech 截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解:铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址: https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新 注意:后续的更新,大部分会在Bohrium课程平台进行,请看教程入门的同学加入课程进行学习;且录制的视频课程会把一些个人观点给加入,从个人观点来看比文字教程的内容更多 写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备; ABACUS软件的QQ群:759914681,群内有专职开发人员,目前ABACUS提问问题以github的issue为主,群内可作为辅助提问。 欢迎大家推广本教程,让更多的dp入门学习者有个参考,目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师(我也报名了小马老师的一对一辅导)。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。 |