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4.1.1.1.1 训练集和探索集设置
元素类型和元素质量,元素原子质量在LAMMPS模拟中会使用 "init_data_prefix": "/home/zxg/BeCu/dpgennew/deepmd_file/", "init_data_sys": [ "Be108_fcc", "Be128_hcp", "Be16_hcp", "Be32_fcc", "Be54_hcp", "Be127_Cu1_hcp", "Be15_Cu1_hcp", "Be52_Cu2_hcp", "Be53_Cu1_hcp", "Be53_Cu1_hcp_sa_plane", "Be52_Cu2_hcp_sp_plane", "Be31_Cu2_fcc", "Be32_Cu1_fcc", "Be52_Cu2_cubic", "Be53_Cu1_cubic", "Be46_Cu2_tetragonal", "Be47_Cu1_tetragonal" ], init_data_prefix":#训练集所在的文件夹前置路径,这里可以让后边少写一些重复路径信息 "init_data_sys":#训练集所在的文件夹或文件夹的上层等文件夹,就是在这个文件夹下会有训练集。 关于初始训练集所在位置,我把所有训练集都放到了deepmd_file下,并以文件夹命名。此处需要提出以下,只要"init_data_sys"指定到一个文件夹,那么这个文件夹下所有的训练集都会被包含,DPGEN有自动搜索deepmd文件功能。我这里做了细分是为了方便后续我删除某些数据做准备。 初始训练集的准备在前一章已经做了,当然是准备的越合理越好,可以把所有训练集都加入到训练中去;以我的铜掺杂铍晶体为例,我初始构型经过简化后共17个,后续如果想扩展相关研究可能还会额外加入新训练集,需要在DPGEN的输入脚本param.json这里进行对应的修改。
作者:朱雪刚 邮箱:xuegangzhu@qq.com; 工作单位:石家庄学院 理学院/北京科学智能研究院(AISI)访问学者2023.07-2024.09,访问导师北京大学陈默涵; 徐张满仓 邮箱: xuzhangmancang@dp.tech 截止2024.07.21录制视频教程已上传至Bohrium的课程《DeePMD应用案例讲解:铜原子掺杂铍晶体的机器学习势函数拟合过程演示》网址: https://bohrium.dp.tech/courses/1075495070?tab=courses 后续会在Bohrium平台更新 注意:后续的更新,大部分会在Bohrium课程平台进行,请看教程入门的同学加入课程进行学习;且录制的视频课程会把一些个人观点给加入,从个人观点来看比文字教程的内容更多 写教程内容讨论QQ群:143276924 DPGEN+ABACUS教程准备; ABACUS软件的QQ群:759914681,群内有专职开发人员,目前ABACUS提问问题以github的issue为主,群内可作为辅助提问。 欢迎大家推广本教程,让更多的dp入门学习者有个参考,目前2024.09.16我联系的微信公众号推广是 lammps加油站的小马老师(我也报名了小马老师的一对一辅导)。当然也看到lammps爱好者在转发推广。感谢大家公众号的推广。 |

