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Selections-keywords说明

时间:2025-04-23     作者:邱新龙翻译【转载】   来自:vmd手册   阅读

name:原子名

type:原子类型

backbonetype:骨架类型

residuetype:残基类型(蛋白)

index:原子序号(从0开始)

serial:原子序号(从1开始)

element:元素

residue:残基序号

resname:残基名

resid:残基序号

chain:链名,以TER为标识,如果没有只有x

numbonds:成键数目

structure:二级结构

x,y,z:X/Y/Z笛卡尔坐标

vx,vy,vz:X/Y/Z方向速度

beta:pdb文件中的beta值

occupancy:pdb文件中的原子占有率

mass:原子质量

charge:原子电荷

phi、psi:蛋白质骨架角度

radius:原子半径


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