draw

VMD提供了一种方式来显示由图形原语（如点、线、圆柱体、锥体、球体、三角形和文本）构建的用户定义对象。因为这些都是在场景中显示的，就像所有其他图形一样，它们也可以导出到各种光线追踪格式，3d打印机等。

用户定义的图形可以用来在分子周围画一个框，在两个原子之间画一个箭头，在空间的某个地方放置一个文本标签，或者测试一种可视化分子的新方法。

draw命令是一个直接的Tcl函数，它旨在简化图形命令的接口，并为扩展标准图形原语提供基础。

draw command [arguments]

draw命令（在大多数情况下）等同于graphics top command [arguments]，因为它只是将图形原语添加到顶部分子，从而省去了输入额外参数的麻烦。然而，draw以两种方式扩展图形。首先，如果没有分子存在，draw会自动为你创建一个。其次，draw可以通过用户定义的绘图命令进行扩展。这是通过定义vmd draw $command形式的函数来完成的。如果函数存在，则调用第一个参数作为分子索引，其余参数作为原始draw调用的参数。下面是一个扩展了draw命令以包含“arrow”原语的示例。

proc vmd_draw_arrow {mol start end} {

set middle [vecadd $start [vecscale 0.9 [vecsub $end $start]]]

graphics $mol cylinder $start $middle radius 0.15

graphics $mol cone $middle $end radius 0.25

}

# 箭头是由圆柱体和圆锥体组成的

在VMD中输入该命令后，可以使用draw arrow{0 0 0}  {1 11 1}等命令绘制箭头。除了定义新命令外，用户定义的绘图命令还可以用于覆盖现有命令。例如，如果您定义vmd绘制球体，那么绘制球体{0 0 0}将调用您的球体例程，而不是图形中的例程。

这里有一个快速的方法来添加你自己的标签原子选择。这个函数接受选择文本和给定字符串中原子（在最上面的分子中）的标签。如果选择了除一个原子以外的其他元素，则返回错误。

proc label_atom {selection_string label_string} {

set sel [atomselect top $selection_string]

if {[$sel num] != 1} {

error "label_atom: ’$selection_string’ must select 1 atom"

}

# get the coordinates of the atom

lassign [$sel get {x y z}] coord

# and draw the text

draw text $coord $label_string

}