SET UP

Task：选择你要计算的任务

Quality：选择能量与力的收敛标准

Functional：选择你需要的泛函

Use method for DFT-D correction：是否使用弱相互作用校正

Spin unrestricted: 选中时，表示将使用不同自旋的不同轨道进行计算。这被称为“spin-unrestricted”或“spin-polarized”计算。如果不选中，计算将使用相同的轨道进行α和β自旋。这被称为“spin-unrestricted”或“spin-polarized”计算。默认设置为未选中。

Use formal spin as initial: 选中时，表示每个原子的未配对电子数的初始值将取自为每个原子引入的形式自旋。该起始值随后将在计算过程中进行优化。默认值=选中。

只有选中“Spin unrestricted”复选框时，才会启用此选项。

Metal：当检查时，这表明系统是金属的，需要对布里渊区进行热涂抹和密集采样。如果未选中，默认情况下使用的k点间距较粗，并且不使用涂抹。默认设置为未选中。此选项仅适用于周期系统。

Use symmetry: 选中时，表示应在计算中使用对称性信息。涉及过渡态搜索或确认的分子动力学模拟或计算不能使用对称性信息。默认值=选中。

由于DMol3服务器强制的对称捕捉，在DMol3计算中获得的总能量和其他特性在使用对称设置为开和关之间可能略有不同。这种数值效应在高度对称的分子系统中可能很明显。

当“Functional”设置为B3LYP或HF时，或当“Task”设置为“ Dynamics”、“TS Search”、“TS Confirmation”、“Reaction Kinetics”或“Electron Transport”时，“Use symmetry”复选框不可用。在这些情况下，将不使用对称性。

Multiplicity：从下拉列表中选择多重性以对特定旋转状态执行计算。

Charge:：指定分子或晶胞上的总电荷。

DMol3可以使用分数电荷进行操作，但非整数电荷只能通过手动编辑DMol3输入文件来指定。

当“Task”设置为“Electron Transport”时，“Spin”和“Charge”控件将被禁用。

Energy：执行单点能量计算。

Geometry Optimization：搜索最小能量结构。

Dynamics：执行分子动力学计算。

TS Search：使用线性同步传输（LST）和二次同步传输（QST）方法搜索过渡状态。

TS Optimization：使用特征向量以下方法搜索转换状态。

TS Confirmation：基于LST或QST搜索生成精细的反应路径。

Elastic Constants：执行弹性常数计算。

Reaction Kinetics：计算已知过渡状态的反应的速率系数。

Electron Transport：计算电子输运特性，如传输和电流。

Minimum Energy Path：计算能量能垒和反应路径。

Quality：设置DMol3计算的总体精度。这种精度影响基组、k点和SCF收敛标准，以及相关任务的收敛标准。可用选项包括：

Coarse

Medium

Fine

这三个级别以较长的计算时间为代价，逐渐提供更高的精度。

使用“Coarse”设置可以快速评估计算，然后升级到更高的质量级别以获得更准确的结果。

“Quality”设置会影响控制模拟精度的所有相关任务参数。如果用户将任何参数设置为与总体精度级别指定的值不同的值，则“Quality”将显示为“Customized”。

杂化泛函使用的体系

HSE06是目前运用最广泛的杂化泛函方法，一般适用于半导体体系。

PBE0适用于固体体系。 

B3LYP适用于分子体系。

LDA: 局域密度泛函

CA-PZ

m-GGA: 含动能梯度的广义梯度密度泛函

RSCAN

Hybrid: 杂化泛函

PBE0

B3LYP

HSE03

HSE06

GGA: 广义梯度密度泛函

PBE

RPBE

PW91

WC

PBESOL

BLYP

Nonlocal: 非局域形式泛函

HF

HF-LDA

sX

sX-LDA

在DMOL3中处理固体周期性体系常用GGA-PBE泛函

综上可知杂化泛函计算比较浪费时间及服务器内存，因此运用杂化泛函计算结构能带步骤如下：

1）结构优化（PBE泛函）

2）静态计算（分别用PBE和杂化泛函）

3）能带计算（杂化泛函）

使用 DFT-D 校正方法：选择此选项后，色散校正将使用所选方法。 可用选项有：

TS 适用于 GGA PBE、PBESOL、RPBE、BLYP、PW91； 也适用于 PBE0 和 B3LYP

Grimme 适用于 GGA PBE、GGA BLYP 和 B3LYP

所选选项会自动更新DMOL3 电子选项对话框的 DFT-D 选项卡上的使用自定义 DFT-D 参数选项。

Use method for DFT-D correction：DFT-D矫正是加入长程相互作用，描述氢键、范德瓦尔斯等弱相互作用，常用的选择有：Tkatchenko-Scheffler（TS）（GGA-PBE、GGA-BLYP，B3LYP），Grimme（GGA-PBE、GGA-BLYP，B3LYP），OBS（GGA-PW91，LDA）。弱相互作用的选取与具体的体系元素有关，如下图所示：

Auto

Singlet

Doublet

Triplet

Quartet

Quintet

Sextet

Septet

Octet

当选择Auto（自动）时，DMol3将尝试通过执行旋转不受限制的计算来确定地面旋转状态。仅当选中“Spin unrestricted”复选框且未选中“Use formal spin as initial”复选复选框时，才启用此选项。

Use formal spin as initial：不可能强制DMol3执行不受限制的单线态计算。如果选中“Spin unrestricted”复选框并将“Multiplicity”设置为“Singlet”，则结果将与使用“Auto”设置时的结果相同。

在周期系统的情况下，多重性是指单个晶胞中电子的自旋状态。