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Selections-其他语法说明时间:2025-04-23 serial 1 to 9 1号到9号 不用在9前面写serial了 and/or/not 交集/并集/非集 ( )/{}划分为整体,()的优先级高于没有,低于{} 数学符合::< <= = >= > != 可以用 计算符合::+ - * / **(平方) ^(平方) sqr(平方), sqrt(开根号), abs(绝对值), sin, cos, tan, atan, asin, acos, sinh, cosh, tanh, exp, log, log10 same residue as (x-20)^2+(y-20)^2 <= 400 same residue as (x-20)^2+(y-20)^2+(z-20)^2 <= 400 (same residue as within 3 of resname MOL) and resname SOL 寻找MOL3A范围内的残基,并且保持完整,最后和SOL求并集 pbwithin会考虑周期性边界/within不考虑 exwithin使用可以排除自身 withinbonds 2 of MOL表示 MOL周边含有双键的原子 same A as B 表示A与B相同的属性 ringsize 6 from MOL表示MOL上面的6圆环 maxringsize 6 from MOL表示MOL上面的含6圆环以内的圆环结构 name CA CB :名为CA和CB的原子,如果后续继续加仍然可以使用, name "C.":名字为两个字符且第一个字符为C的原子 name "C..":名字为三个字符且第一个字符为C的原子 name "CE[1-3]":名字为CE1、CE2、CE3的原子 name 'O5*':叫O5*的原子。注意原子名带星号的在选取时要用单引号括住以免转义 resname 'CA2+':残基名是CA2+的原子(二价钙离子)。名字带正负号的也要用单引号括住以免转义 |