详细内容

Dynamics

image.png

Ensemble:选择一个热力学系综用于动力学计算。可用选项包括:

NVE(默认)-固定体积和恒定能量下的动力学

NVT-固定体积下的动态特性,带恒温器以保持恒定温度

Initial velocities:选择用于初始化动力学计算的速度的方法。可用选项包括:

Random(默认)-在指定温度下基于Maxwell Boltzmann分布的随机初始化

Current-基于当前结构上定义的速度进行初始化。

如果将“Initial velocities”指定为“Current”,并且在任何原子上都没有速度,则Materials Studio会报告警告,并在选择继续时默认为“Random”。

Temperature:指定模拟的目标温度,单位为K。对于NVE系综,这将原子的初始随机速度缩放到这个温度。默认值=300.0 K。

Time step:指定每个动力学步长的时间(以fs为单位)。该值还确定“Total simulation time”。默认值为1.0 fs。

Total simulation time:指定动力学模拟将运行的总时间(以ps为单位)。该值还确定步骤数。默认值=1.0 ps。

Number of steps:指定执行的动力学步骤数。该值还确定“Total simulation time”。默认值=1000。


image.png

恒温器:选择用于控制NVT模拟温度的算法。可用选项包括:

Gaussian                                                            Simple NH—Nosé-Hoover

NH Chain—Nosé-Hoover链                       Massive NH—大规模Nosé-Hoover

GGM—广义高斯矩                                          Massive GGM(默认)-大规模广义高斯矩

Nosé Q ratio:指定用于缩放Nosé-Hooper恒温器的虚拟质量Q的值。较大的Q比意味着温度波动的阻尼减小。默认值=2.0。

如果选择了Gaussian、GGM或Massive GGM恒温器,则禁用此控制。

Chain length:指定要与NH Chain、Massive NH和GGM方法一起使用的恒温器链的长度。默认值=2。

如果选择了“Gaussian”或“Simple NH”,则会禁用此控制。

Relaxation time:将广义高斯矩方法的恒温器松弛时间指定为时间步长的倍数。默认值为10.0。

如果选择了“Gaussian”、“Simple NH”、“NH Chain”或“Massive NH”,则禁用此控制。

Yoshida parameter:指定Nosé和广义高斯矩方法的积分精度的时间步长参数。可用选项包括:

1.        3(默认)           5.

7.        25

如果选择了高斯恒温器,则禁用此控制。


最新评论
请先登录才能进行回复登录
技术支持: CLOUD | 管理登录
seo seo