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构建晶体表面

建立一个晶体表面,例如,Pt <111>为一个定义的Miller Plane。

导入晶体结构

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打开一个需要晶体结构的CIF文件,或者从内置的Avogadro晶体库导入一个。本教程假设您从Avogadro库导入了一个结构。选择File > Import > Crystal来打开库。

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要么浏览晶体,要么按元素或名称输入过滤器。单击“Insert”以导入所选结构。

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导入一个晶体将显示不对称的晶胞(例如,这里的一个原子表示银)。

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要生成指定的表面(例如:Ag <121>),请选择Crystallography > Build > Slab…,以调出Slab构建器设置。未来的晶体构建器(例如,纳米颗粒,超晶胞)也将出现在这个菜单。

所需的Miller平面的索引(对于六角形晶胞,所有4个索引都将出现),并选择结果表面的距离或重复晶胞的维数。生成的表面在XY平面上对齐,在XY平面下的z轴上切割指定的厚度。这一特性使得新的表面和分子之间可以很容易地进行表面相互作用的计算。单击“Build”开始生成表面。



单击“Build,”之后,Avogadro将生成一个大的超晶胞,对齐、旋转和切割指定的表面。这可能需要一些时间,取决于晶胞的大小。在这里,半透明的van der Waals球是用来说明波纹的银<121>表面。得到的曲面是一个2x2的超晶胞,在z轴上有一个大的间距(40 Å)。

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