详细内容

SET UP

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Task:选择你要计算的任务

Quality:选择计算的相关精度

Calculate Hessian:计算Hessian矩阵

Restart:选中后,使用相同或不同的参数继续先前的动力学或剪切运行

Append to current trajectory: 选中时,将重新启动的动力学或剪切运行中的新帧附加到输入轨迹的末尾。如果未选中此选项,作业将创建一个新轨迹,仅包含连续运行中的帧。

Frame filter: 指定活动轨迹文档中要包含在计算中的帧。默认设置为ALL。

您可以使用单个帧数的组合或用连字符分隔的范围,例如1,2,10,41-59,88。如果要指定一个范围,直到并包括最后一帧,请使用语法END或美元符号($),例如66-END或66-$。也可以使用语法CURRENT来指示轨迹的当前帧,例如CURRENT-END或1-CURRENT。


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Energy:执行单点能量计算

Geometry Optimization :搜索最小能量结构

Dynamics:执行分子动力学计算

Quench:执行淬火动力学计算

Anneal:执行退火动力学计算

Shear:执行剪切模拟

Confined Shear:模拟半刚性墙或表面之间流体的剪切流动

Cohesive Energy Density:计算材料单位体积的内聚能

Mechanical Properties:计算材料的各种机械性能

Solvation Free Energy:计算系统溶剂化的自由能


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Coarse:如果结构优化难收敛,可以先选这个再选精度更高的进行优化

Medium:如果结构优化难收敛,可以先选这个再选精度更高的进行优化

Fine:结构优化需要的精度,以及计算后续性质必须符合的精度

Ultra-fine:你需要非常高的精度,就用这个


“Quality”设置会影响控制计算精度的所有相关任务参数。在基于原子的方法的情况下,总体Quality水平决定了Ewald处理非键相互作用的精度和非键截止距离。对于几何体优化,“Quality”还会影响能量优化的收敛公差设置。


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