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运行输入文件

tpr 系统拓扑,参数,坐标和速度(二进制,便携式)

cpt 检查点文件


运行输入文件-tpr

tpr 文件扩展名代表便携式二进制运行输入文件。这类文件包含了模拟的初始结构,分子拓扑和所有的模拟参数。因为此文件为二进制格式,所以无法使用普通编辑器读取。要读取便携式二进制运行输入文件,可以使用:

gmx dump -s topol.tpr

或者,如果你的阅读速度不是很快,可以使用:

gmx dump -s topol.tpr | less

你还可以使用以下方法比较两个 tpr 文件:

gmx check -s1 top1 -s2 top2 | less

image.png


运行输入文件-cpt

cpt 文件扩展名代表便携式检查点文件。模拟的完整状态存储在检查点文件中,包括扩展恒温器/恒压器变量,随机数状态以及 NMR 的时间平均数据。如果使用了区域分解,检查点文件中还会存储一些区域分解设置的信息。


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