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vmd建溶剂化结构

时间:2025-04-26     作者:邱新龙翻译【转载】   来自:vmd手册   阅读

same residue as within 3 of resname zn

3是根据径向分布函数判断

第一步找出所有的分布 

根据配位数判断为下图

由于不好作图,此时可以修改

先用mouse>labe>atom找到zn原子编号

然后点击Zn,进行查找,然后再点击取消

image.png


same residue as within 3 of serial 1

全屏只剩下这个,serial为文件中的排序原子为1号 

same residue as的使用是保持残基完整,否则只会筛选出原子

image.png


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