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Ramachandran 分析时间：2025-04-28 Ramachandran 图是评估蛋白质二级结构稳定性和构象动态的重要工具。它通过展示蛋白质残基的 φ 和 ψ 二面角分布，反映了蛋白质的二级结构特征。在Ramachandran 图中，不同的二级结构区域具有特定的 φ 和 ψ 角度范围，如 α-螺旋通常位于(-60°, -45°)和(-45°, 15°)的区域，而 β-折叠则位于(-135°, 135°)的区域。蛋白 B 蛋白构象的 Ramachandran 分析如图 1-4 所示,图 1-4A 显示，该蛋白质的二级结构分布较为均衡，α-螺旋、β-折叠、左手螺旋和左手 α-螺旋等区域均有分布。图 1-4B 进一步展示了二级结构随时间的变化趋势，其中 α-螺旋和 β-折叠的比例相对稳定，表明这些区域在模拟过程中保持了较好的结构稳定性。图 1-4C的热图则揭示了特定残基的二级结构变化情况，为理解蛋白质功能和动力学提供了重要信息。
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