LPS Modeler

Lipopolysaccharide, LPS脂多糖 Modeler简化了各种LPS结构和PSF文件的生成。

请注意

支持ECODAB中提供的大多数大肠杆菌O抗原血清型；只需单击O抗原血清型。

目前，有15种细菌，37种脂质A型，52种核心寡糖型和304种O抗原多糖型。

请让我们知道任何缺失的LPS结构及其参考的顺序。我们将考虑添加该结构，作为我们扩展LPS Modeler数据库的持续努力的一部分。

参考文献

S. Jo, T. Kim, V.G. Iyer, and W. Im (2008)

CHARMM-GUI: A Web-based Graphical User Interface for CHARMM. J. Comput. Chem. 29:1859-1865

J. Lee, D.S. Patel, J. Ståhle, S-J. Park, N.R. Kern, S. Kim, J. Lee, X. Cheng, M.A. Valvano, O. Holst, Y. Knirel, Y. Qi, S. Jo, J.B. Klauda, G. Widmalm, and W. Im (2019)

CHARMM-GUI Membrane Builder for Complex Biological Membrane Simulations with Glycolipids and Lipoglycans. J. Chem. Theory Comput. 15:775-786

第1步

画分子

脂多糖

脂多糖（英语：Lipopolysaccharide，缩写: LPS）是由一种脂质和一种多糖组成的大分子，是细菌毒素。

它们由含O-抗原、外核、内核组成，均以共价键连接，存在于细菌荚膜中，即革兰氏阴性细菌（如大肠杆菌和沙门氏菌）细胞膜的最外层。

脂多糖通常由三部分组成：

多糖链，又称多聚O抗原链(O polysaccharide) ，是细菌菌体抗原的抗原决定簇。由多个寡糖重复单位组成。 通常由1至6个糖残基重复单位构成，具有很高的可变性。

核心多糖，在结构上分为内核心寡糖和外核心寡糖，其中内核心寡糖由3个KDO结构和3个庚糖结构组成。

脂质A，是细菌内毒素活性的根源，并且帮助脂多糖分子锚定在外膜上。

https://zh.wikipedia.org/wiki/%E8%84%82%E5%A4%9A%E7%B3%96