构建碳纳米管

Avogadro 1.1包括一个新的纳米管构建器，基于著名的TubeGen代码和来自特拉华大学多伦集团的网站。 (http://turin.nss.udel.edu/research/tubegenonline.html)

在Build菜单下，有一个针对纳米管构建器的新选项。目前只有单壁纳米管(SWNT)可以一步完成，尽管多壁管(MWNT)很容易生成几个嵌套管，如下图所示。

构建器将显示在Avogadro窗口的底部。你可以设置n，m指数来确定类型的纳米管(1)管的长度, (2)在埃,波尔,皮米,纳米,或周期盒子（unit cell）(例如,如果你想做一个计算周期边界条件),以及如何终止纳米管(3)。注意:确定双键可以耗费时间在大的纳米管。

纳米管将沿z轴方向生成，因此您可能希望重新调整视图的中心。

在这里，我们在插入我们的4,4纳米管之后添加了一个6,6纳米管。我们需要重新调整管子的中心，以制造出更精确的双壁系统。

在这里，我们使用新的Avogadro 1.1中的手动转换选项，将XY平面上的6,6纳米管“nudge（轻推）”围绕4,4纳米管的中心。

在这里，我们已经轻推6,6管到一个近似正确的位置。现在我们将使用Avogadro内置的力场和自动优化工具来放松结构。

我们(1)选择自动优化工具，允许交互最小化纳米管，(2)选择MMFF94力场。其他的力场也可能工作得很好。最后(3)开始优化。

经过几个步骤，你可以看到一个非常放松的双壁纳米管。您可以按需要重复这个过程。