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gro格式说明具有“.gro”文件扩展名的文件存储了以Gromos87格式编码的分子结构信息。这些文件可以通过简单的文件拼接操作,被处理为分子动力学模拟中的轨迹数据
第一行:注释行 第二行:原子数目 左对齐 列 说明 格式 对齐 1-5 残基序号 整数 右 6-10 残基名 字符 左 11-15 原子名 字符 右 16-20 原子序号 整数 右 当原子或者残基数量超过99999后就按0开始重新排号 21-28 直角x坐标nm 8.3 右 29-36 直角y坐标nm 8.3 右 37-44 直角z坐标nm 8.3 右 45-52 x方向速度nm/ps 7.4 右 53-60 y方向速度nm/ps 7.4 右 61-68 z方向速度nm/ps 7.4 右 盒子晶体描述a(x,y,z) b(x,y,z) c(x,y,z) 小数点后5位 自由格式,空格分隔 a(x) b(y) c(z) a(y) a(z) b(x) b(z) c(x) c(y) 最后六个值可以省略并设为0.00000 Gromacs仅支持满足a(y)=a(z)=b(z)=0条件的盒子 |

