宏观体系中的物质数量与模拟的微观相差太大,存在着很明显的边界效应
在现实中水分子与玻璃壁之间会有影响
减少了玻璃壁旁边的水分子相互作用
如果模拟的也有这个壁的影响
由于模拟的数量远远小于现实
所以这个影响会很大
如果加入周期性边界那么就相当于模拟溶液中间的位置
这样就没玻璃壁的一个影响
这样的做法是增加对于体系的采样
并不是说的单纯只是为了增加计算速度