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QTAIM分析

在分子中使用原子(Bader)分析-QTAIM和WFN

Avogadro 现在包括对理查德·贝德教授和他的团队开发的QTAIM分析的支持。这项技术使Avogadro能够直接从量子力学电子密度中确定键连接和键序。


首先打开WFN文件

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大多数量子化学软件允许从一个计算的输出创建一个WFN格式的文件。我们可以通过QTAIM扩展读取这个文件,以便进行可视化和分析。将来,还将支持其他格式,包括直接从检查点文件派生数据。

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这里我们使用Molecular Graph + Lone Pairs命令选择了一个感兴趣的WFN文件(HCO2)。

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Avogadro 的QTAIM支持将读取原子,使用AIM分析确定键和键序,然后继续进一步分析。

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一开始,你可能看不到任何不同。QTAIM包括一个单独的显示类型,用于查看AIM分析的结果。

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在这里,我们已经启用了QTAIM显示,它将显示孤对、键临界点等。您可能还希望关闭Ball和Stick模型来查看所有的AIM注释。

在这里,我们还关闭了传统的球棒显示类型,只留下HCO2的QTAIM视图。

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