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5.4.3主窗口动画控件时间:2025-06-14 VMD中的每个分子可以包含多组原子坐标,这些原子坐标可以动画化以显示其随时间的运动。坐标集可以来自分子动力学模拟,或者只是相同分子结构的多个版本。主窗口包含这些轨迹的动画回放控件。控件包含几个按钮,其作用类似于VCR或DVD播放器上的按钮。这些按钮提供了播放轨迹、前进、停止、转到特定帧以及转到开始或结束的方式。动画控件中显示的状态和帧计数器反映了顶部分子的状态。然而,通过该控件输入的命令会影响所有活动分子[§5.4.2],而不仅仅是最上面的分子,从而允许多个分子并发动画。
动画速度Animation Speed播放速率可以通过两种方式控制。Step控件改变动画步长。默认情况下,帧步长为1,因此播放的每一步增加(或减少)动画帧数1。如果帧步长为5,那么动画将以5倍的速度进行,因为只显示五分之一的帧。窗口底部的速度滑块也会影响播放速度。在内部,它控制每个步骤之间需要多少屏幕更新。默认情况下,滑块位于最右边,表示每次重绘屏幕执行一个步骤。将滑块向左移动会增加更新之间所需的最短时间。
跳到特定帧Jumping to Specific Frames开始和结束按钮用于简化初始和最终结构之间的比较。开始按钮将当前动画重置到第一帧,结束按钮跳转到最后一帧。如果需要跳转到特定的帧,请在开始按钮旁边的帧计数器文本区域输入帧号,然后按回车键。要记住的一件事是,帧数从0开始,所以要跳到第五帧,你必须在这里输入4。动画控件都是相对于顶部分子的。
循环方式Looping Styles当动画向前播放并到达顶部分子可用数据的末尾时,将按照样式选择器中指定的方式,从三种可能的操作中选择一种。默认设置是“Loop”,这将把活动分子重置到第一帧,并继续向前播放。“Once”将在动画到达最后一帧时停止动画,而“Rock”将反转动画的方向。当动画反向播放时,动作是对称的。
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