5.4.5鼠标菜单

鼠标菜单指示并控制鼠标在图形窗口内移动和单击时的行为。鼠标单击和拖动可以通过以下两种方式之一影响VMD。它可以通过旋转、平移或缩放来改变场景的视图。它还可以选择场景中的对象，导致采取一些进一步的行动。这些行为都反映在鼠标菜单的状态中。

下面，我们描述鼠标菜单的主要部分。

鼠标模式Mouse modes

当用户用鼠标左键点击并拖动时，前三个菜单项选择鼠标是否旋转、平移或缩放场景。

选择模式Pick modes-Center

改变VMD旋转和缩放场景的方式。为了感受这是如何工作的，从鼠标菜单中选择“居中”，然后单击场景中的原子。如果你现在用鼠标左键点击和拖动来旋转场景，场景就会围绕选定的原子旋转。如果您使用“查看模式”下拉菜单将查看模式更改为“缩放”，则场景将在保持所选原子在视图中时展开。被选中的原子将保持在中心位置，直到一个新原子被选为“中心”，“重置视图”按钮被按下，或者一个新分子被加载。

选择模式Pick modes-Query

在文本控制台窗口上打印有关项目的信息（例如原子名称）。

选择模式Pick modes-Label

向场景中的原子添加标签。标签包括原子、键、角和二面体。这些标签分别需要选择一个、两个、三个和四个原子。对于后三种标签类型，将显示几何标签的数值，以及连接所选原子的点画线。“bond”的单位与坐标文件所使用的单位相对应。“角”和“双角”是用度来测量的。然后可以通过“标签”窗口操作标签。

选择模式Pick modes-Move

改变场景中原子的实际坐标。注意，这与简单地更改视图不同。点击Mode菜单中的一个按钮，选择要移动的原子组。”Atom“只移动选定的原子”。残基“移动与选定原子相同残基中的所有原子（例如，氨基酸或核苷酸）。”碎片“移动所有通过键连接到被选中的原子上的原子。”分子“移动分子结构中的每个原子”。“高亮代表”是最灵活的；它移动图形窗口的浏览器窗口中高亮显示的所有原子。通过点击和拖动鼠标左键来移动原子。如果在移动鼠标时按住shift键，则受影响的原子将围绕所选原子旋转。旋转原子与左键围绕屏幕的x或y轴旋转；使用中键或右键旋转，围绕垂直于屏幕的轴旋转。注意，目前没有办法撤消Move操作，因此应该首先将原子坐标保存到一个文件中。

选择模式Pick modes-Force

在运行的模拟中对选定的原子施加一个力。只有在建立了IMD连接后，才能看到这些作用力。用鼠标左键点击并拖动将对选定的原子、残留或碎片施加一个力，就像在移动模式中一样。点击中间或右键将取消所选原子上的力。

选择模式Pick modes-Move Light

允许灯光在场景周围定位。在显示窗口中打开或关闭单个灯。在“移动光源”菜单中选择一个光源，使所选光源围绕原点旋转。移动光模式也可以通过改变到任何其他选择模式或鼠标模式来取消。

选择模式Pick modes-Add/Remove Bonds

如果没有键，则在两个单击的原子之间添加键，否则删除键。两个原子必须属于同一个分子。