双层膜double-member.inp

tolerance 2.0 #表示原子间的距离不能小于2.0A

add_box_sides 1.2 #表示给盒子的方向增加1.2A，目的是为了避免边界的原子和镜像盒子里的原子间存在不合理接触

output double-member.pdb #表示输出double-member的文件

structure SDS.pdb #表示输入结构SDS

number 200 #表示输入结构的个数为200个

inside box 0. 0. 0. 50 50 20 #设置盒子大小为0 0 0 到 50 50 20的长方形盒子

atoms 39 #固定原子编号为39

  below plane 0. 0. 1. 1. #原子39号在平行于XY平面,在小于1A范围移动

end atoms #第一次固定原子行为结束

atoms 1 #固定原子编号为1

  over plane 0. 0. 1. 17.4                #原子1号在平行于XY平面,在大于17.4A范围移动

end atoms                                      #第一次固定原子行为结束

end structure #完成此次结构输入

structure SDS.pdb #表示输入结构SDS

number 200 #表示输入结构的个数为200个

inside box 0. 0. 20. 50 50 40 #设置盒子大小为0 0 0 到 50 50 20的长方形盒子

atoms 1 #固定原子编号为1

  below plane 0. 0. 1. 21. #原子39号在平行于XY平面,在小于1A范围移动

end atoms #第一次固定原子行为结束

atoms 39 #固定原子编号为39

  over plane 0. 0. 1. 37.4                #原子1号在平行于XY平面,在大于17.4A范围移动

end atoms                                        #第一次固定原子行为结束

end structure #完成此次结构输入