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gmx densmap
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -od densmap1.dat -o densmap1.xpm *此时只会生成 densmap1.dat文件，后续的xpm无法生成，所以使用时注意
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap1.xpm gmx xpm2ps -f densmap1.xpm -o densmap1.eps -rainbow blue
使用时，输入了-od就不能再输入-o ，使用-o 就不要用-od
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap2.xpm -b 2000 -e 2000 gmx xpm2ps -f densmap2.xpm -o densmap2.eps -rainbow blue
查看的这个是某帧的结构 gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap3.xpm -bin 1 gmx xpm2ps -f densmap3.xpm -o densmap3.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -od densmap3.dat -bin 5 gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -od densmap3-1.dat -bin 1 gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -od densmap3-2.dat -bin 0.1
网格变大数据点就会变少，没啥事就不需要调整这个地方 gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap4.xpm -aver y gmx xpm2ps -f densmap4.xpm -o densmap4.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap5.xpm -aver z gmx xpm2ps -f densmap5.xpm -o densmap5.eps -rainbow blue -aver y是求平面xz -aver x是求平面yz -aver z是求平面xy（默认值）
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap6.xpm -xmin 1 gmx xpm2ps -f densmap6.xpm -o densmap6.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap7.xpm -xmax 0.2 gmx xpm2ps -f densmap7.xpm -o densmap7.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap8.xpm -xmin 0.5 -xmax 0.6 gmx xpm2ps -f densmap8.xpm -o densmap8.eps -rainbow blue 最大最小密度问题
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap9.xpm -n1 10 gmx xpm2ps -f densmap9.xpm -o densmap9.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap10.xpm -n2 10 gmx xpm2ps -f densmap10.xpm -o densmap10.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap11.xpm -n1 10 -n2 10 gmx xpm2ps -f densmap11.xpm -o densmap11.eps -rainbow blue
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap12.xpm -amax 1 -rmax 1 gmx xpm2ps -f densmap12.xpm -o densmap12.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap13.xpm -amax 1 -rmax 0.1 gmx xpm2ps -f densmap13.xpm -o densmap13.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap14.xpm -amax 0.1 -rmax 1 gmx xpm2ps -f densmap14.xpm -o densmap14.eps -rainbow blue
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap15.xpm -mirror -amax 1 -rmax 1 gmx xpm2ps -f densmap15.xpm -o densmap15.eps -rainbow blue
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap16.xpm -sums gmx xpm2ps -f densmap16.xpm -o densmap16.eps -rainbow blue 将密度累加值(1D映射图)输出到屏幕
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap17.xpm -unit nm-2 gmx xpm2ps -f densmap17.xpm -o densmap17.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap18.xpm -unit count gmx xpm2ps -f densmap18.xpm -o densmap18.eps -rainbow blue 看标尺，数值变化
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap19.xpm -dmin 20 gmx xpm2ps -f densmap19.xpm -o densmap19.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap20.xpm -dmax 50 gmx xpm2ps -f densmap20.xpm -o densmap20.eps -rainbow blue gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap21.xpm -dmax 50 -dmin 20 gmx xpm2ps -f densmap21.xpm -o densmap21.eps -rainbow blue 看标尺就懂了
gmx densmap -f npt.trr -s npt.tpr -o densmap22.xpm -w gmx xpm2ps -f densmap22.xpm -o densmap22.eps -rainbow blue 不知道有啥用，感觉好像没啥结果出来 |
