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正方体cube.inp时间：2025-04-25 tolerance 2.0#表示原子间的距离不能小于2.0A add_box_sides 1.2 #表示给盒子的方向增加1.2A，目的是为了避免边界的原子和镜像盒子里的原子间存在不合理接触 output cube.pdb #表示输出cube的文件 structure h2o.pdb #表示输入结构h2o number 3000 #表示输入结构的个数为3000个 inside cube 0. 0. 0. 50. #表示正方体一个数值最小的顶点为0 0 0坐标，边长为50A end structure #完成此次结构输入
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